Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bcas2Q9D287 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bcas2Q9D287 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bcas2Q9D287 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bcas2Q9D287 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms