Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ube2cQ9D1C1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2cQ9D1C1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms