Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms