Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Susd3Q9D176 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Susd3Q9D176 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Susd3Q9D176 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Susd3Q9D176 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Susd3Q9D176 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Susd3Q9D176 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms