Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms