Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp11Q9CZJ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms