Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl35Q9CZ49 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms