Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsfl1cQ9CZ44 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsfl1cQ9CZ44 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsfl1cQ9CZ44 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsfl1cQ9CZ44 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsfl1cQ9CZ44 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nsfl1cQ9CZ44 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsfl1cQ9CZ44 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms