Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrps28Q9CY16 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms