Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CXL3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CXL3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CXL3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms