Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms