Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm5Q9CXE0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms