Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gje1Q9CX92 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gje1Q9CX92 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms