Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yif1bQ9CX30 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yif1bQ9CX30 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms