Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms