Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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