Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BccipQ9CWI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BccipQ9CWI3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BccipQ9CWI3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BccipQ9CWI3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BccipQ9CWI3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BccipQ9CWI3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BccipQ9CWI3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BccipQ9CWI3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms