Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms