Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms