Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Sycp2Q9CUU3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Sycp2Q9CUU3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms