Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhfpl3Q9CTN8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms