Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms