Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr3kQ9CQZ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr3kQ9CQZ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms