Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms