Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Map1lc3bQ9CQV6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms