Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms