Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms