Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms