Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdelr2Q9CQM2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdelr2Q9CQM2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdelr2Q9CQM2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdelr2Q9CQM2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdelr2Q9CQM2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdelr2Q9CQM2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdelr2Q9CQM2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kdelr2Q9CQM2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kdelr2Q9CQM2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdelr2Q9CQM2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms