Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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