Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd1Q9CQK7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd1Q9CQK7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms