Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdm1Q9CQK3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms