Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms