Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms