Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rab5aQ9CQD1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rab5aQ9CQD1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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