Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms