Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnaseh2cQ9CQ18 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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