Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc18Q9CQ07 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms