Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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