Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms