Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim8Q99PJ2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim8Q99PJ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim8Q99PJ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms