Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms