Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms