Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ms4a8Q99N10 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ms4a8Q99N10 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ms4a8Q99N10 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ms4a8Q99N10 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ms4a8Q99N10 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ms4a8Q99N10 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ms4a8Q99N10 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ms4a8Q99N10 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ms4a8Q99N10 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ms4a8Q99N10 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ms4a8Q99N10 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ms4a8Q99N10 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ms4a8Q99N10 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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