Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6bQ99N09 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms