Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms