Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprtQ99M80 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprtQ99M80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms