Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5rap3Q99LM2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk5rap3Q99LM2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms