Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms