Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms